ცირკონიუმს აქვს ძალიან დაბალი ტოქსიკურობა და დადგენილია, რომ ადამიანი ჭამს დაახლოებით 50 მიკროგრამს (1.8 x 10-6 უნცია) დღეში, რომლის უმეტესი ნაწილი გადის საჭმლის მომნელებელ სისტემაში შეწოვის გარეშე, Lenntech-ის თანახმად.